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快3平台2023-01-31 16:05

提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

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香港教育及职业博览开幕 提供最新教育与职业资讯******

  中新社香港2月2日电 (记者 戴小橦)香港贸易发展局(贸发局)主办的“教育及职业博览2023”(博览)2日在香港会议展览中心举行开幕典礼。贸发局署理总裁张淑芬致辞时表示,教育及职业博览为不同机构和雇主提供最新的教育机会和职业选择,为学生和求职者提供一个独特的交流平台,期待来访者在博览中能找到新机遇。

香港惩教署设展位向市民介绍其工作。 陈永诺 摄香港惩教署设展位向市民介绍其工作。 陈永诺 摄

  此次博览为期4天,以“多元出路成就可能”为主题,分为教育及职业两大专区,在现场设置摊位的700多间机构就升学、进修和就业等为参观者提供多元资讯。另外,关于粤港澳大湾区建设为香港青年在就学、实习、就业和创业等方面带来的机遇也会有举办相应的讲座进行推广宣传。

  香港特区政府教育局在今年首次参与博览,并在现场设置摊位,还将举行以“发挥一专多能启发学生潜能”为主题的职业讲座。

  教育局局长蔡若莲表示,教育及职业博览是教育机构及私人企业向公众发放最新进修和职业资讯的重要平台,与特区政府致力提供优质、灵活、多元和多阶进出升学途径的政策不谋而合。特区政府会加大力度以多管齐下方式推广职专教育,与传统学术教育双轨并行,鼓励产教融合、校企合作,提供多元化的学习和就业机会,培育更多掌握应用技能的高质量人才。

  记者在现场看到,香港警队以及香港海关亦有设置摊位。警务处处长萧泽颐当日到摊位参观时与前来咨询的市民交谈,并鼓励他们积极投考警队。(完)

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